En los últimos años se han creado nuevas áreas, grupos y laboratorios dentro de los distintos Departamentos y Secciones que componen el MNHN.

Es así que en la Sección mamíferos se ha consolidado el "Laboratorio de Mamíferos Marinos", el GIM (Grupo de Investigación de Murciélagos) y recientemente se está conformando el "Laboratorio de Carnívoros".

En 2010 se produce la creación del ABC (Área de Biodiversidad y Conservación), nueva área del Museo dedicada al estudio de la integral de la biodiversidad, conservación y cambio climático.